圣歷年間，武則天以其杰出的韜略和睿智把國家治理得有聲有色、國泰民安。雖然朝中李、武兩家爭奪皇權的斗爭依舊暗潮涌動，武則天臨危不亂，泰然處之。可是一個突然出現的謀殺事件，卻把久居皇宮的武則天引出京城遭遇了一次驚險離奇的經歷，也使得早已懸印歸家的狄仁杰不得不重陷你爭我奪的官場斗爭…… 一天夜里，多年服伺武則天的貼身宮女阿香突然刺殺女皇，未遂被殺，但心有余悸的武則天卻不相信阿香是真正的兇手，她連夜頒旨讓大理寺迅速查清妄想謀殺她的真正元兇。誰知，查案還剛剛開始，御醫徐大夫卻吊死在自己的房中，阿香的尸體也不翼而飛。武則天深感事態嚴重，馬上手書兩道圣旨，急詔狄仁杰回宮解難。辭官回鄉的狄仁杰正和手下喬泰、馬榮忙著為多年的隨從陶甘舉辦喜事，太原知府計中來到狄村，證明陶甘和馬榮是殺死了京城派來信使的兇手。 武則天得不到狄仁杰消息十分憂慮，借口有病需要靜養，把皇權暫交兒子李哲與侄子武三思，帶著上官婉兒和男寵張昌宗，出京尋找狄仁杰。逃過一路追殺，武則天歷盡艱辛終于來到狄村，卻中計被告知：想要謀害她的人就是眼前回家閑居的狄仁杰…… 深深了解狄仁杰的武則天看出這是有人設下的圈套。狄府中，女皇與狄仁杰徹夜長談，兩人都感到了案件的背后隱藏著一個陰險的人物。面對危難，狄仁杰接受武則天的任命追查兇手。第二天，在為武則天接風的酒宴上，忠厚老實的喬泰突然發瘋，武則天險些在混亂中喪命。透過血雨腥風的廝殺中，狄仁杰終于發現：陶甘的新娘-東方雨竟是對手派來的殺手。面對錯綜復雜的連環案，狄仁杰巧設妙計引出了設計謀殺的元兇--太原知府計中。狄仁杰在審問計中時又發現新的疑點，而自傲的武則天卻執意要立斬計中，即刻返回京城。狄仁杰在不能驚動官方的情況下，只好組織村民護著女皇啟程回京，誰知半路武則天與婉兒被劫，狄仁杰護駕受傷。 武則天受害的消息傳到京城，朝廷一片混亂。張昌宗帶著圣旨回到京城，要太子讓權武三思；而上官婉兒也出現在太子府里，親口指出張昌宗假傳圣旨，與武三思勾結有謀反之心。張柬之擁兵京城要替百姓維護李家天下。太平公主幾進太子府逼迫軟弱的哥哥讓權于她。正當各路人馬張弓拔弩之時，信使送來武則天圣旨，原來遇難王村的武則天已經被狄仁杰救出回到京城。飽經磨難的武則天皇威依舊，她不動聲色地收回皇權并吩咐所有人馬回宮聽旨，因為狄仁杰已經查出這次謀殺案真正的指使者。
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