一場突如其來的鼠疫在德國科隆降臨。一時之間，街道、下水道、家里、垃圾堆，到處都堆滿了老鼠。一例例被感染的病人相繼死去。一批批的人被強硬隔離起來，恐懼與慌亂隨著空氣一起蔓延開來，整個城市被死神的陰影籠罩著。事發于一個流浪漢猝死街頭，令人難以置信地顯現了黑死病地癥候，綜合醫療調查組的馬丁·布魯格醫生和疾病控制專家克萊蒙·林德斯爾在這座古城發現了可怕的一幕。大堆的死鼠堵塞了下水道，是它們引起瘟疫的嗎？為了避免市民恐慌，政府沒有接受專家的意見。只是一些要人也開始變得奄奄一息時，事情才明朗起來……
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